Microbiome eDNA preservation study using sediment samples from Crete (16S rRNA)

Sampling event
最新バージョン Hellenic Center for Marine Research により出版 7月 9, 2026 Hellenic Center for Marine Research
公開日:
2026年7月9日
ライセンス:
CC-BY 4.0

DwC-A形式のリソース データまたは EML / RTF 形式のリソース メタデータの最新バージョンをダウンロード：

DwC ファイルとしてのデータ ダウンロード 19 レコード English で (4 MB) - 更新頻度: not planned
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説明

Comparison of the impact of different preservatives and storage conditions in the marine microbial communities (sediment). -This dataset is part of the same Microbiome eDNA preservation study for 16S rRNA and 18S rRNA.Links for each dataset of the project-> eDNA 16S water: https://ipt.medobis.eu/resource?r=edna-16s-water, eDNA 16S sediment: https://ipt.medobis.eu/resource?r=edna, eDNA 18S water:https://ipt.medobis.eu/resource?r=edna-18s-water, eDNA 18S sediment:https://ipt.medobis.eu/resource?r=edna-18s-sediment -

データ レコード

この sampling event リソース内のデータは、1 つまたは複数のデータ テーブルとして生物多様性データを共有するための標準化された形式であるダーウィン コア アーカイブ (DwC-A) として公開されています。 コア データ テーブルには、19 レコードが含まれています。

拡張データ テーブルは2 件存在しています。拡張レコードは、コアのレコードについての追加情報を提供するものです。 各拡張データ テーブル内のレコード数を以下に示します。

Event (コア)
19
dnaDerivedData 
73387
Occurrence 
73387

この IPT はデータをアーカイブし、データ リポジトリとして機能します。データとリソースのメタデータは、 ダウンロード セクションからダウンロードできます。 バージョン テーブルから公開可能な他のバージョンを閲覧でき、リソースに加えられた変更を知ることができます。

バージョン

次の表は、公にアクセス可能な公開バージョンのリソースのみ表示しています。

引用方法

研究者はこの研究内容を以下のように引用する必要があります。:

Pavloudi C, Stavroulaki M, Santi I (2026). Microbiome eDNA preservation study using sediment samples from Crete (16S rRNA). Version 1.3. Hellenic Center for Marine Research. Samplingevent dataset. https://ipt.medobis.eu/resource?r=edna&v=1.3

権利

研究者は権利に関する下記ステートメントを尊重する必要があります。:

パブリッシャーとライセンス保持者権利者は Hellenic Center for Marine Research。 This work is licensed under a Creative Commons Attribution (CC-BY 4.0) License.

GBIF登録

このリソースは GBIF に登録されていません。

キーワード

Bacteria; Eukaryota; 16S rRNA; 18S rRNA; preservative; DESS; DNA/RNA shield; seawater; sediment; Other

外部データ

リソース データは他の形式で入手可能です。

Best Practices to preserve marine samples microbiome community prior DNA extraction https://www.ebi.ac.uk/ena/browser/view/PRJEB108325 ASCII Fastq

連絡先

Christina Pavloudi
  • メタデータ提供者 ●
  • 最初のデータ採集者 ●
  • 連絡先
  • Data scientist
European Marine Biological Resource Centre (EMBRC-ERIC)
FR
Melanthia Stavroulaki
  • 最初のデータ採集者
  • Research fellow at IMBBC, National Communication Officer for EMBRC Operational, Contact for EMO BON (GR)
HCMR-IMBBC
GR
Ioulia Santi
  • 最初のデータ採集者 ●
  • 連絡先
  • Observation, Data and Service Development Officer
European Marine Biological Resource Centre (EMBRC-ERIC)
GR
Melina Loulakaki
  • キュレーター
  • Computer scientist
HCMR-IMBBC
GR

地理的範囲

South West [35.334891 N, 25.278761 E], North East [35.346621 N, 25.282741 E]

座標（緯度経度） 南 西 [35.333, 25.253], 北 東 [35.347, 25.3]

生物分類学的範囲

Bacteria, Eukaryota

Kingdom Bacteria, Eukaryota

時間的範囲

開始日 2021-03-29

プロジェクトデータ

The core mission of the DTO-BioFlow Project is to unlock those “sleeping” biodiversity data enabling the sustained flow of these and new data via primary integrators and EMODnet into the EU Digital Twin Ocean. It will create a digital replica of marine biological processes transforming new and existing data flows into evidence-based knowledge. The project aligns with the EU's Biodiversity Strategy and Nature Restoration Law and with the mission "Restore our oceans and waters by 2030", both of which advocate for the protection and restoration of land and sea regions.

タイトル DTO-BioFlow: Integration of biodiversity monitoring data into the Digital Twin Ocean
識別子 Subsidy agreement ID 101112823
ファンデイング This work used resources provided by the European Marine Omics Biodiversity Observation Network (EMO BON) project, coordinated by the European Marine Biological Resource Centre - European Research Infrastructure Consortium (EMBRC-ERIC).
Study Area Description Samples were collected at the EMO BON observatory HCMR-1 (Aegean Sea, Greece).

プロジェクトに携わる要員:

Christina Pavloudi

追加のメタデータ