Microbiome eDNA preservation study using sediment samples from Crete (18S rRNA)

Evento de muestreo
Última versión publicado por Hellenic Center for Marine Research el jul 9, 2026 Hellenic Center for Marine Research
Fecha de publicación:
9 de julio de 2026
Licencia:
CC-BY 4.0

Descargue la última versión de los datos como un Archivo Darwin Core (DwC-A) o los metadatos como EML o RTF:

Datos como un archivo DwC-A descargar 19 registros en Inglés (2 MB) - Frecuencia de actualización: no planeado
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Descripción

Comparison of the impact of different preservatives and storage conditions in the marine microbial communities (sediment). -This dataset is part of the same Microbiome eDNA preservation study for 16S rRNA and 18S rRNA.Links for each dataset of the project-> eDNA 16S water: https://ipt.medobis.eu/resource?r=edna-16s-water, eDNA 16S sediment: https://ipt.medobis.eu/resource?r=edna, eDNA 18S water:https://ipt.medobis.eu/resource?r=edna-18s-water, eDNA 18S sediment:https://ipt.medobis.eu/resource?r=edna-18s-sediment -

Registros

Los datos en este recurso de evento de muestreo han sido publicados como Archivo Darwin Core(DwC-A), el cual es un formato estándar para compartir datos de biodiversidad como un conjunto de una o más tablas de datos. La tabla de datos del core contiene 19 registros.

también existen 2 tablas de datos de extensiones. Un registro en una extensión provee información adicional sobre un registro en el core. El número de registros en cada tabla de datos de la extensión se ilustra a continuación.

Event (core)
19
dnaDerivedData 
52416
Occurrence 
52416

Este IPT archiva los datos y, por lo tanto, sirve como repositorio de datos. Los datos y los metadatos del recurso están disponibles para su descarga en la sección descargas. La tabla versiones enumera otras versiones del recurso que se han puesto a disposición del público y permite seguir los cambios realizados en el recurso a lo largo del tiempo.

Versiones

La siguiente tabla muestra sólo las versiones publicadas del recurso que son de acceso público.

¿Cómo referenciar?

Los usuarios deben citar este trabajo de la siguiente manera:

Pavloudi C, Stavroulaki M, Santi I (2026). Microbiome eDNA preservation study using sediment samples from Crete (18S rRNA). Version 1.2. Hellenic Center for Marine Research. Samplingevent dataset. https://ipt.medobis.eu/resource?r=edna-18s-sediment&v=1.2

Derechos

Los usuarios deben respetar los siguientes derechos de uso:

El publicador y propietario de los derechos de este trabajo es Hellenic Center for Marine Research. Esta obra está bajo una licencia Creative Commons de Atribución/Reconocimiento (CC-BY 4.0).

Registro GBIF

Este recurso no ha sido registrado en GBIF

Palabras clave

Bacteria; Eukaryota; 18S rRNA; preservative; DESS; DNA/RNA shield; sediment; Other

Datos externos

Los datos del recurso también están disponibles en otros formatos

Best Practices to preserve marine samples microbiome community prior DNA extraction https://www.ebi.ac.uk/ena/browser/view/PRJEB108325 ASCII Fastq

Contactos

Christina Pavloudi
  • Proveedor De Los Metadatos ●
  • Originador ●
  • Punto De Contacto
  • Data scientist
European Marine Biological Resource Centre (EMBRC-ERIC)
FR
Melanthia Stavroulaki
  • Originador
  • Research fellow at IMBBC, National Communication Officer for EMBRC Operational, Contact for EMO BON (GR)
HCMR-IMBBC
GR
Ioulia Santi
  • Originador ●
  • Punto De Contacto
  • Observation, Data and Service Development Officer
European Marine Biological Resource Centre (EMBRC-ERIC)
GR
Melina Loulakaki
  • Curador
  • Computer scientist
HCMR-IMBBC
GR

Cobertura geográfica

South West [35.334891 N, 25.278761 E], North East [35.346621 N, 25.282741 E]

Coordenadas límite Latitud Mínima Longitud Mínima [35,333, 25,253], Latitud Máxima Longitud Máxima [35,347, 25,3]

Cobertura taxonómica

Bacteria, Eukaryota

Reino Bacteria, Eukaryota

Cobertura temporal

Fecha Inicial 2021-03-29

Datos del proyecto

The core mission of the DTO-BioFlow Project is to unlock those “sleeping” biodiversity data enabling the sustained flow of these and new data via primary integrators and EMODnet into the EU Digital Twin Ocean. It will create a digital replica of marine biological processes transforming new and existing data flows into evidence-based knowledge. The project aligns with the EU's Biodiversity Strategy and Nature Restoration Law and with the mission "Restore our oceans and waters by 2030", both of which advocate for the protection and restoration of land and sea regions.

Título DTO-BioFlow: Integration of biodiversity monitoring data into the Digital Twin Ocean
Identificador Subsidy agreement ID 101112823
Fuentes de Financiación This work used resources provided by the European Marine Omics Biodiversity Observation Network (EMO BON) project, coordinated by the European Marine Biological Resource Centre - European Research Infrastructure Consortium (EMBRC-ERIC).

Personas asociadas al proyecto:

Christina Pavloudi

Metadatos adicionales