Microbiome eDNA preservation study using water samples from Crete (18S rRNA)

Sampling event
Versão mais recente published by Hellenic Center for Marine Research on jul. 9, 2026 Hellenic Center for Marine Research
Publication date:
9 de julho de 2026
Licença:
CC-BY 4.0

Baixe a última versão do recurso de dados, como um Darwin Core Archive (DwC-A) ou recurso de metadados, como EML ou RTF:

Dados como um arquivo DwC-A download 20 registros em English (2 MB) - Frequência de atualização: não plenejado
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Metadados como um arquivo RTF download em English (9 KB)

Descrição

Comparison of the impact of different preservatives and storage conditions in the marine microbial communities (water). -This dataset is part of the same Microbiome eDNA preservation study for 16S rRNA and 18S rRNA. Links for each dataset of the project-> eDNA 16S water: https://ipt.medobis.eu/resource?r=edna-16s-water, eDNA 16S sediment: https://ipt.medobis.eu/resource?r=edna, eDNA 18S water:https://ipt.medobis.eu/resource?r=edna-18s-water, eDNA 18S sediment:https://ipt.medobis.eu/resource?r=edna-18s-sediment -

Registros de Dados

Os dados deste recurso de evento de amostragem foram publicados como um Darwin Core Archive (DwC-A), que é o formato padronizado para compartilhamento de dados de biodiversidade como um conjunto de uma ou mais tabelas de dados. A tabela de dados do núcleo contém 20 registros.

Também existem 2 tabelas de dados de extensão. Um registro de extensão fornece informações adicionais sobre um registro do núcleo. O número de registros em cada tabela de dados de extensão é ilustrado abaixo.

Event (core)
20
dnaDerivedData 
53065
Occurrence 
53065

This IPT archives the data and thus serves as the data repository. The data and resource metadata are available for download in the downloads section. The versions table lists other versions of the resource that have been made publicly available and allows tracking changes made to the resource over time.

Versões

A tabela abaixo mostra apenas versões de recursos que são publicamente acessíveis.

Como citar

Pesquisadores deveriam citar esta obra da seguinte maneira:

Pavloudi C, Stavroulaki M, Santi I (2026). Microbiome eDNA preservation study using water samples from Crete (18S rRNA). Version 1.2. Hellenic Center for Marine Research. Samplingevent dataset. https://ipt.medobis.eu/resource?r=edna-18s-water&v=1.2

Direitos

Pesquisadores devem respeitar a seguinte declaração de direitos:

O editor e o detentor dos direitos deste trabalho é Hellenic Center for Marine Research. This work is licensed under a Creative Commons Attribution (CC-BY 4.0) License.

GBIF Registration

Este recurso não foi registrado pelo GBIF

Palavras-chave

Bacteria; Eukaryota; 18S rRNA; preservative; DESS; DNA/RNA shield; seawater; Other

Dados externos

Os dados de recurso também estão disponíveis em outros formatos

Best Practices to preserve marine samples microbiome community prior DNA extraction https://www.ebi.ac.uk/ena/browser/view/PRJEB108325 ASCII Fastq

Contatos

Christina Pavloudi
  • Provedor Dos Metadados ●
  • Originador ●
  • Ponto De Contato
  • Data scientist
European Marine Biological Resource Centre (EMBRC-ERIC)
FR
Melanthia Stavroulaki
  • Originador
  • Research fellow at IMBBC, National Communication Officer for EMBRC Operational, Contact for EMO BON (GR)
HCMR-IMBBC
GR
Ioulia Santi
  • Originador ●
  • Ponto De Contato
  • Observation, Data and Service Development Officer
European Marine Biological Resource Centre (EMBRC-ERIC)
GR
Melina Loulakaki
  • Curador
  • Computer scientist
HCMR-IMBBC
GR

Cobertura Geográfica

South West [35.334891 N, 25.278761 E], North East [35.346621 N, 25.282741 E]

Coordenadas delimitadoras Sul Oeste [35,333, 25,253], Norte Leste [35,347, 25,3]

Cobertura Taxonômica

Bacteria, Eukaryota

Reino Bacteria, Eukaryota

Cobertura Temporal

Data Inicial 2021-03-29

Dados Sobre o Projeto

The core mission of the DTO-BioFlow Project is to unlock those “sleeping” biodiversity data enabling the sustained flow of these and new data via primary integrators and EMODnet into the EU Digital Twin Ocean. It will create a digital replica of marine biological processes transforming new and existing data flows into evidence-based knowledge. The project aligns with the EU's Biodiversity Strategy and Nature Restoration Law and with the mission "Restore our oceans and waters by 2030", both of which advocate for the protection and restoration of land and sea regions.

Título DTO-BioFlow: Integration of biodiversity monitoring data into the Digital Twin Ocean
Identificador Subsidy agreement ID 101112823
Financiamento This work used resources provided by the European Marine Omics Biodiversity Observation Network (EMO BON) project, coordinated by the European Marine Biological Resource Centre - European Research Infrastructure Consortium (EMBRC-ERIC).
Descrição da Área de Estudo Samples were collected at the EMO BON observatory HCMR-1 (Aegean Sea, Greece).

O pessoal envolvido no projeto:

Christina Pavloudi

Metadados Adicionais